holobionte

Biologie

Entité vivante naturelle, constituée d’un organisme (animal ou plante) et de son microbiote (bactéries, virus, archées, protistes et champignons microscopiques).

n. m.

syn. : supraorganisme, métaorganisme.

Voir : archéeplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigarchée

Organisme procaryote (ne comprenant ni noyau, ni organite), mais différents des bactéries., bactérieplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigbactérie

Microorganisme unicellulaire (de 1 à quelques micromètres) ne possédant pas de noyau véritable (procaryote), ni d’autres organites., microbioteplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigmicrobiote

Ensemble de microorganismes (bactéries, virus, champignons non pathogènes, parasites) vivant dans un milieu particulier., organismeplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigorganisme

Entité vivante possédant une unité d’organisation et de fonctionnement., protisteplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigprotiste

Organisme eucaryote unicellulaire de nature végétale (protophyte) ou animale (protozoaire)., virusplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigvirus

Parasite obligatoire de cellules (procaryotes ou eucaryotes), dont la multiplication ne peut s’effectuer qu’au sein d’une cellule-hôte..

Informations complémentaires

Aujourd’hui, il est établi qu’un organisme ne peut vivre sans les microbiotes dont il est l’hôte. Un vers de terre, tout simple qu’il soit, abrite dans son intestin un microbiote qui est indispensable à la digestion des matières organiques qu’il ingère.

Voir : digestionplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigdigestion

Processus au cours duquel de la matière organique passe d’une forme complexe inutilisable directement, en molécules plus simples assimilables (nutriments), pour un organisme comme pour une cellule., matière organiqueplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigmatière organique

Matière synthétisée par les êtres vivants..

Les mycorhizes

Les mycorhizes qui sont l’association des mycéliums de champignons avec les racines des plantes supérieures chlorophylliennes, sont non seulement des structures dont la fonction est trophique pour les champignons et pour les plantes, mais dont les fonctions sont aussi protectrices contre les pathogènes puisqu’elles synthétisent des fongicides et des antibiotiques. L’ensemble mycorhizien (plante + microbiote) pourrait être assimilé à un holobionte.

Voir : antibiotiqueplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigantibiotique

Substance naturelle ou artificielle ayant, à faible dose, une action bactériostatique (empêchant la multiplication de bactéries) et, à plus fortes doses, une action bactéricide (tuant les bactéries)., fongicideplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigfongicide

Substance chimique utilisée pour détruire des champignons parasites d’animaux, de plantes ou de l’homme., mycéliumplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigmycélium

Appareil végétatif des champignons constitué de filaments microscopiques non chlorophylliens (hyphes), formant un feutrage sur ou dans le substrat où ils se développent, et d’organes reproducteurs visibles à l’œil nu (chapeaux de certains champignons)., mycorhizeplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigmycorhize

Association du mycélium d’un champignon avec les racines d’une plante supérieure chlorophyllienne., pathogèneplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigpathogène

Se dit d’agents pouvant provoquer une maladie : virus, bactéries, champignons, protozoaires, et autres parasites, mais aussi agents chimiques (nicotine, mercure) ou physiques (rayonnements nucléaires)., racineplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigracine

Organe végétatif des végétaux vasculaires prélevant, dans le milieu, les nutriments et l’eau nécessaires à leur métabolisme., trophiqueplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigtrophique

Qualifie ce qui concerne la nutrition de tous les êtres vivants..

Génome de l’hôte et métagénome

Les interactions symbiotiques entre hôte et microbiote sont aujourd’hui mieux connues, et on peut considérer que l’ensemble des génomes des microorganismes d’un microbiote (le métagénome) apporte sa contribution fonctionnelle au fonctionnement du génome de l’hôte. C’est pourquoi certains auteurs considèrent le métagénome comme une « extension » du génome de l’hôte.

Voir : génomeplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_biggénome

Ensemble des gènes portés par les molécules d’ADN du noyau (génome nucléaire), des mitochondries (génome mitochondrial) et des chloroplastes (génome chloroplastique), les molécules d’ADN des bactéries, ou par les acides nucléiques viraux (ARN ou ADN)., métagénomeplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigmétagénome

Ensemble des génomes des populations de micro-organismes d’un milieu particulier., symbioseplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigsymbiose

Relation impliquant une interdépendance entre des organismes appartenant à des espèces différentes..

Réflexion pédagogique

La notion d’holobionte renvoie bien sûr à celle de symbiote qui s’applique aux organismes vivant en symbiose. L’holobionte qui est un organisme constitué de plusieurs êtres vivants, est qualifié de métaorganisme.

Cette considération conduit à réfléchir à la notion de synergie. En effet, dans le cas du mutualisme symbiotique, telle qu’il est défini dans ce glossaire (en accord avec le sens commun), la symbiose est indispensable à chacun des partenaires de la symbiose.

Voir : mutualisme symbiotiqueplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigmutualisme symbiotique [alias]

Voir : symbiose mutualiste., symbioteplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigsymbiote

Être vivant associé à un autre, avec bénéfices réciproques., synergieplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigsynergie

Phénomène obtenu lorsque les actions combinées d’au moins deux éléments différents donnent un résultat plus important que la somme des effets attendus de chacun d’eux pris séparément..

Remarque linguistique et/ou historique

Dans les années 1990, s’appuyant sur une approche holistique, Lynn Margulis (voir l’entrée « théorie endosymbiotique ») utilise pour la première fois le terme holobionte pour proposer la théorie que les plastes et les mitochondries dériveraient de cellules procaryotes devenues hôtes permanents d’organismes unicellulaires, établissant des rapports symbiotiques avec eux.

L’approche holistique met l’accent sur les interrelations entre les différents éléments d’un système, et entre le système et son environnement, plutôt que sur les éléments pris isolément.

Voir : théorie endosymbiotiqueplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigthéorie endosymbiotique

Théorie selon laquelle les plastes et les mitochondries dériveraient de cellules procaryotes devenues hôtes permanents d’organismes unicellulaires, établissant des rapports symbiotiques avec eux..