dégradation de la matière organique

Définition

Simplification des espèces chimiques constituant les débris et déchets provenant des êtres vivants (végétaux morts, cadavres et déjections des animaux, etc.), jusqu’à un état minéral : molécules simples, dioxyde de carbone (CO₂), et eau (H₂O), ou ions, tels que les nitrates (NO₃^-), et les phosphates (PO₄^3-).

e. f.

syn. : décomposition de la matière organique.

Voir : déchetplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigdéchet

Ce qui reste d’une matière, d’un objet, après son emploi., déjectionplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigdéjection

Matières évacuées par un organisme animal., dioxyde de carboneplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigdioxyde de carbone

Corps composé, formé de l’association d’un atome de carbone (C) avec deux atomes d’oxygène (O), gazeux dans les conditions de température et de pression régnant sur Terre., espèce chimiqueplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigespèce chimique

Terme générique désignant une molécule, un atome, un ion, ou encore, un radical., être vivantplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigêtre vivant

Entité formée d’une ou plusieurs cellules, qui dès son début d’existence possède un métabolisme qui lui permet d’être actif ; sa mort le rend inactif (inerte)., ionplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigion

Atome, molécule, ayant cédé ou acquis un ou plusieurs électrons., matière organiqueplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigmatière organique

Matière synthétisée par les êtres vivants., moléculeplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigmolécule

Association d’un nombre fini d’atomes liés entre eux par des liaisons en général covalentes et parfois ioniques., nitrateplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bignitrate

Sel de l’acide nitrique (HNO3) ou ion nitrate (NO3-)., phosphateplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigphosphate

Sel de l’acide phosphorique (H3PO4) ou ion phosphate (PO43-)..

Informations complémentaires

La décomposition de la matière organique est le résultat d’un ensemble de réactions d’oxydation par les microorganismes du sol et des microbiotes intestinaux des détritivores.

La première phase de la dégradation de la matière organique est celle de la fragmentation des débris organiques par les détritivores (lombrics, insectes, et champignons). C’est l’humification qui conduit à la formation de l’humus. Au sein des détritivores, la simplification moléculaire se fait par le métabolisme cellulaire et celui de leurs microbiotes intestinaux. Les déchets qu’ils évacuent sont décomposés par la microflore et la microfaune du sol, les éléments chimiques (carbone, oxygène, azote, phosphore, etc.) retournant à la phase minérale des cycles biogéochimiques.

Voir : azoteplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigazote

Élément chimique de symbole N, ou nom donné ordinairement au gaz (N2), corps simple dont les molécules sont constituées de deux atomes (diazote)., carboneplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigcarbone

Élément chimique de symbole C se présentant sous forme de corps simples, purs, cristallisés (diamant, graphite) ou non (fullerènes)., cycle biogéochimiqueplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigcycle biogéochimique

Ensemble des échanges d’un élément chimique particulier (carbone, azote), ou d’une molécule (l’eau, par exemple), entre l’atmosphère, l’hydrosphère et la lithosphère, en interaction avec les êtres vivants., détritivoreplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigdétritivore

Organisme se nourrissant de détritus organiques qu’il dégrade (débris végétaux, cadavres), les transformant en matière plus simple dont peuvent se nourrir les décomposeurs participant au même réseau trophique., élément chimiqueplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigélément chimique

Les substances constituées datomes identiques, liés par des liaisons chimiques formant des molécules sont des corps simples., humificationplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bighumification

Ensemble de processus biochimiques réalisés par la microfaune et la microflore, qui concoure à la transformation en humus de la matière organique de la litière., humusplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bighumus

Fraction organique de la couche superficielle du sol, formée par un ensemble complexe de déchets végétaux et animaux plus ou moins décomposés., métabolismeplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigmétabolisme

Ensemble des réactions physico-chimiques fournissant aux organismes l’énergie et la matière organique nécessaires au fonctionnement cellulaire., microbioteplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigmicrobiote

Ensemble de microorganismes (bactéries, virus, champignons non pathogènes, parasites) vivant dans un milieu particulier., microfauneplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigmicrofaune [alias]

Voir : faune., microfloreplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigmicroflore

Ensemble d’organismes microscopiques (bactéries, certains champignons et végétaux) présents dans un milieu., microorganismeplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigmicroorganisme

Organisme visible seulement au microscope., oxydationplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigoxydation

Réaction chimique au cours de laquelle une espèce chimique (atome ou molécule) est oxydée par perte d’un ou de plusieurs électrons, perte pouvant être combinée à celle de protons (H+). L’espèce chimique réceptrice est dite réduite., oxygèneplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigoxygène

Élément chimique de symbole O, ou nom donné ordinairement au dioxygène (O2), gaz inodore et sans saveur., phosphoreplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigphosphore

Le phosphore est l’élément chimique de numéro atomique 15, de symbole P., solplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigsol

Partie superficielle émergée de l’écorce terrestre, plus ou moins meuble, de structure et de qualité variable, cultivée ou non..

Réflexion pédagogique

Il ne faut pas confondre la décomposition de la matière organique dans l’environnement et les processus de dégradation lors du catabolisme au sein d’un organisme. Lors du catabolisme, les différentes transformations chimiques sont contrôlées par des mécanismes de régulation (homéostasie). Il n’y a que très rarement épuisement total d’un nutriment (il y a tout le temps du glucose dans l’organisme).

Au sein de l’humus, chaque décomposeur est actif tant qu’il y a un substrat qui lui convient.

Voir : catabolismeplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigcatabolisme

Ensemble de réactions métaboliques aboutissant à la simplification de molécules organiques plus ou moins complexes., décomposeurplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigdécomposeur

Organisme se nourrissant de détritus organiques (débris végétaux et fungiques, cadavres ou excréments), participant à la chaîne des dégradations de la matière organique., glucoseplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigglucose

Ose (C6H12O6) essentiel pour toutes les cellules eucaryotes (animales comme végétales), formé en fin de photosynthèse., homéostasieplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bighoméostasie

État d’équilibre dynamique du milieu intérieur d’un organisme, malgré les variations de l’environnement, nécessitant un ensemble de mécanismes et un apport permanent d’énergie., organismeplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigorganisme

Entité vivante possédant une unité d’organisation et de fonctionnement., nutrimentplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bignutriment

Élément chimique ou molécule relativement simple, soluble, utilisable sans transformation lors du métabolisme cellulaire., substratplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigsubstrat

Support physique d’une culture permettant la fixation des racines..

Remarque linguistique et/ou historique

En s’inspirant du domaine médical, certains parlent de « décompensation » de la matière organique qui se dégrade en raison de la fonte du pergélisol (permafrost). La matière organique gelée étant considérée (métaphoriquement) comme un organe vital de la Planète, ce choix est sémantiquement intéressant.

Voir : pergélisolplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigpergélisol

Sol gelé en permanence en profondeur., permafrostplugin-autotooltip__small plugin-autotooltip__blue plugin-autotooltip_bigpermafrost [alias]

Voir : pergélisol..