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====== variant ======
===== Définition =====
==== Biologie, épidémiologie ====
Cellule présentant un nouveau caractère, suite à l’apparition d'une modification dans son génome (mutation).
**n. m.** (lat. //variatio//).
**Voir :** [[glossaire:entrees:c:caractere|caractère]], [[glossaire:entrees:c:cellule|cellule]], [[glossaire:entrees:g:genome|génome]], [[glossaire:entrees:m:mutation|mutation]].
===== Informations complémentaires =====
Chez les organismes unicellulaires (bactéries, virus, levures, etc.), une mutation entraîne l'émergence d’une cellule (l’organisme variant) dont le génome est légèrement différent de la cellule qui a muté. La multiplication du variant entraine le développement d’une souche de cellules qui sont des variants possédant un ou des caractères nouveaux.
Les variations génétiques conduisant aux variants chez des espèces déjà pathogènes, peuvent (ou non) conférer une plus grande contagiosité, une virulence accrue, une résistance aux traitements, ou aux mécanismes de défense de l’organisme attaqué. Le cumul de toutes ces variations étant très rare, voire quasiment impossible en termes de probabilité.
**Voir :** [[glossaire:entrees:b:bacterie|bactérie]], [[glossaire:entrees:b:biodiversite|biodiversité]], [[glossaire:entrees:c:contagiosite|contagiosité]], [[glossaire:entrees:e:espece|espèce]], [[glossaire:entrees:o:organisme|organisme]], [[glossaire:entrees:p:pathogene|pathogène]], [[glossaire:entrees:r:resistance|résistance]], [[glossaire:entrees:u:unicellulaire|unicellulaire]], [[glossaire:entrees:v:virulence|virulence]], [[glossaire:entrees:v:virus|virus]].
==== Conséquences des mutations sur les propriétés des virus ====
Tous les virus mutent au fil du temps. Ce sont des erreurs dans la copie du matériel génétique lors de la reproduction du virus. À côté des questions génétiques et biologiques, les erreurs posent des questions de l’ordre des probabilités (par exemple, pourquoi plus une épidémie progresse, plus le nombre de variants potentiels est grand ?).
Les mutations modifient les protéines qui influent sur la capacité de transmission, la vitesse de réplication ou encore les capacités du virus à contourner notre système immunitaire. Certaines de ces mutations sont telles, que les variants qui en bénéficient sont avantagés et se répandent plus facilement dans la population, mais la plupart des mutations n’ont que peu ou pas d’incidence sur les propriétés du virus.
Il faut signaler aussi que des systèmes naturels de correction des erreurs existent (le Sars-Cov-2, responsable du Covid-19, en est équipé). Ils ralentissent la vitesse à laquelle les erreurs sont maintenues. Le rythme des erreurs conservées est deux fois moins rapide chez le Sars-Cov-2 que pour celui de la grippe, et quatre fois moins élevé qu’avec le virus du VIH.
**Voir :** [[glossaire:entrees:c:covid-19|Covid-19]], [[glossaire:entrees:p:proteine|protéine]], [[glossaire:entrees:s:systeme_immunitaire|système immunitaire]], [[glossaire:entrees:v:vih|VIH]].
==== Suivi des mutations ====
Cependant, certaines mutations peuvent affecter les propriétés du virus et influer, par exemple, sur :
* la transmissibilité : la facilité avec laquelle il se propage ;
* la gravité de la maladie qu’il entraîne ;
* l’échappement immunitaire, l’efficacité des vaccins, des médicaments, des outils de diagnostic ou des autres mesures sociales et de santé publique.
**Voir :** [[glossaire:entrees:e:echappement_immunitaire|échappement immunitaire]], [[glossaire:entrees:v:vaccin|vaccin]].
==== Classification des mutations ====
Divers systèmes sont développés pour détecter d’éventuels variants et les évaluer en fonction du risque pour la santé publique mondiale. À l’échelle mondiale, c’est le Groupe consultatif technique sur l’évolution virale de l’OMS qui fait autorité.
On dispose d’une classification à trois niveaux pour les variants du SARS-CoV-2. Toutefois, les transitions entre ces niveaux sont délicates à apprécier.
**Voir :** [[glossaire:entrees:o:oms|OMS]].
=== Les variants d'intérêt (dits aussi : variants à suivre) ===
Cette catégorie se caractérisent par des modifications génétiques dont on sait qu’elles affectent ou dont on prévoit qu’elles affecteront les caractéristiques du virus pouvant causer une transmission communautaire importante ou plusieurs foyers (clusters) de COVID-19, dans plusieurs pays, entraînant une prévalence relative croissante ainsi qu’une augmentation du nombre de cas dans le temps, ou d’autres conséquences épidémiologiques observables qui font craindre un risque émergent pour la santé publique mondiale.
**Voir :** [[glossaire:entrees:c:cluster|cluster]], [[glossaire:entrees:t:taux_de_prevalence|taux de prévalence]].
=== Les variants préoccupants ===
Aux caractéristiques des variants d’intérêt sont ajoutés :
* l’augmentation de la transmissibilité ;
* l’augmentation de la virulence ou modification du tableau clinique ;
* la diminution de l’efficacité des mesures de santé publique et sociales ou des outils de diagnostic, des vaccins et des traitements disponibles.
=== Les variants à haut risque ===
À l’automne 2021 aucun variant de ce type n’a encore été détecté dans le cas du SARS-Cov-2. Pour cette catégorie, il faut y ajouter par rapport aux catégories précédentes :
* l'échec des diagnostics ;
* une réduction significative de l'effet des vaccins, une résistance plus élevée aux traitements thérapeutiques ;
* des cas de maladies plus graves, avec un nombre accru d'hospitalisations.
==== Nomination des variants ====
À l’heure actuelle, pour rendre la communication sur les variants plus accessible à un public non scientifique, ils sont nommés par des lettres de l’alphabet grec (alpha, bêta, gamma, delta...). Une fois l’alphabet grec épuisé, l’Organisation mondiale de la santé pourrait utiliser des noms d’étoiles ou de constellations.