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====== pangénome  ======

===== Définition =====

<WRAP definition>

<abstract>

Catalogue complet de la diversité génétique d'une espèce.

</abstract>

</WRAP>

<WRAP a_voir>

**n. m.** (gr. //pân//, tout, et génome).

</WRAP>

<WRAP a_voir>

**Voir :** [[glossaire:entrees:d:diversite_genetique|diversité génétique]], [[glossaire:entrees:e:espece|espèce]], [[glossaire:entrees:g:genome|génome]].

</WRAP>

<WRAP t_ic>

===== Informations complémentaires =====

</WRAP>

Le pangénome comprend le génome «de base» contenant les gènes commun à tous les individus, souches, variétés, races, d’une espèce et le génome accessoire, correspondant à des « gènes spécifiques » d’environnements particuliers, et à des «gènes uniques», présents dans un ou plusieurs individus seulement.


Le pangénome contient le même nombre de gènes qu'un génome individuel, mais il donne les différents allèles connus des gènes.


Le pangénome de référence permet d’identifier :


  * les variations génomiques importantes au sein d’une espèce, en particulier en termes d’évolution, et d’adaptation aux contraintes du milieu ;
  * le réservoir de gènes disponibles pour l’amélioration des espèces (espèces cultivées et animaux d’élevage) ;
  * les gènes pouvant expliquer une maladie.

<WRAP a_voir>

**Voir :** [[glossaire:entrees:a:adaptation|adaptation]], [[glossaire:entrees:a:allele|allèle]], [[glossaire:entrees:g:gene|gène]], [[glossaire:entrees:r:race|race]], [[glossaire:entrees:s:souche_cellulaire|souche cellulaire]], [[glossaire:entrees:v:variete|variété]].

</WRAP>

<WRAP ic_rp_rdd_titre_sous>

==== Pangénomes non humains ====

</WRAP>

Ce n’est que ces dernières années, que l’établissement de génomes de référence est devenu moins fastidieux et moins coûteux. Ce qui explique que, jusque là, les scientifiques se concentraient sur les génomes humains et les organismes utilisés comme modèles expérimentaux.


Des machines de séquençage rapides, des algorithmes qui assemblent les lectures de séquences d'ADN en chromosomes complets, des puissances de calcul beaucoup plus grande, ont permis l’établissement de génomes de référence pour d'autres espèces que l’homme.


Des pangénomes d’espèces procaryotes du microbiote intestinal humain sont établies.


<WRAP a_voir>

**Voir :** [[glossaire:entrees:m:microbiote|microbiote]], [[glossaire:entrees:s:sequencage_de_l’adn|séquençage de l’ADN]].

</WRAP>

<WRAP ic_rp_rdd_titre_sous>

==== Pangénomes et métagénome ====

</WRAP>

Les deux notions ne doivent pas être confondues :


  * le métagénome : c’est une méthode d'étude du contenu génétique d'échantillons issus d'environnements complexes : intestins, océans, sols, air, etc. ;
  * le pangénome : c’est un catalogue complet des gènes d’une espèce.

<WRAP a_voir>

**Voir :** [[glossaire:entrees:m:metagenome|métagénome]].

</WRAP>

<WRAP t_rlh>

===== Remarque linguistique et/ou historique =====

</WRAP>

Le décodage de l’intégralité du génome humain a commencé en 1989. C’est en 2001 que le « Human Genome Project » publiait la première version du [[https://dailygeekshow.com/tag/genome|génome]] humain de référence. Des mises à jour régulières ont été effectuées jusqu’à 2023 avec le premier génome humain complet établi à partir de 47 personnes d’origines diverses. Il était prévu d’atteindre 350 individus en 2024.