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====== holobionte ======
==== Biologie ====
Entité vivante naturelle, constituée d'un organisme (animal ou plante) et de son microbiote (bactéries, virus, archées, protistes et champignons microscopiques).
**n. m.**
**syn. :** supraorganisme, métaorganisme.
**Voir :** [[glossaire:entrees:a:archee|archée]], [[glossaire:entrees:b:bacterie|bactérie]], [[glossaire:entrees:m:microbiote|microbiote]], [[glossaire:entrees:o:organisme|organisme]], [[glossaire:entrees:p:protiste|protiste]], [[glossaire:entrees:v:virus|virus]].
===== Informations complémentaires =====
Aujourd’hui, il est établi qu’un organisme ne peut vivre sans les microbiotes dont il est l’hôte. Un vers de terre, tout simple qu’il soit, abrite dans son intestin un microbiote qui est indispensable à la digestion des matières organiques qu’il ingère.
**Voir :** [[glossaire:entrees:d:digestion|digestion]], [[glossaire:entrees:m:matiere_organique|matière organique]].
==== Les mycorhizes ====
Les mycorhizes qui sont l’association des mycéliums de champignons avec les racines des plantes supérieures chlorophylliennes, sont non seulement des structures dont la fonction est trophique pour les champignons et pour les plantes, mais dont les fonctions sont aussi protectrices contre les pathogènes puisqu’elles synthétisent des fongicides et des antibiotiques. L’ensemble mycorhizien (plante + microbiote) pourrait être assimilé à un holobionte.
**Voir :** [[glossaire:entrees:a:antibiotique|antibiotique]], [[glossaire:entrees:f:fongicide|fongicide]], [[glossaire:entrees:m:mycelium|mycélium]], [[glossaire:entrees:m:mycorhize|mycorhize]], [[glossaire:entrees:p:pathogene|pathogène]], [[glossaire:entrees:r:racine|racine]], [[glossaire:entrees:t:trophique|trophique]].
==== Génome de l’hôte et métagénome ====
Les interactions symbiotiques entre hôte et microbiote sont aujourd’hui mieux connues, et on peut considérer que l’ensemble des génomes des microorganismes d’un microbiote (le métagénome) apporte sa contribution fonctionnelle au fonctionnement du génome de l’hôte. C’est pourquoi certains auteurs considèrent le métagénome comme une « extension » du génome de l’hôte.
**Voir :** [[glossaire:entrees:g:genome|génome]], [[glossaire:entrees:m:metagenome|métagénome]], [[glossaire:entrees:s:symbiose|symbiose]].
===== Réflexion pédagogique =====
La notion d’holobionte renvoie bien sûr à celle de symbiote qui s’applique aux organismes vivant en symbiose. L’holobionte qui est un organisme constitué de plusieurs êtres vivants, est qualifié de métaorganisme.
Cette considération conduit à réfléchir à la notion de synergie. En effet, dans le cas du mutualisme symbiotique, telle qu’il est défini dans ce glossaire (en accord avec le sens commun), la symbiose est indispensable à chacun des partenaires de la symbiose.
**Voir :** [[glossaire:entrees:m:mutualisme_symbiotique|mutualisme symbiotique]], [[glossaire:entrees:s:symbiote|symbiote]], [[glossaire:entrees:s:synergie|synergie]].
===== Remarque linguistique et/ou historique =====
Dans les années 1990, s’appuyant sur une approche holistique, Lynn Margulis (voir l’entrée « théorie endosymbiotique ») utilise pour la première fois le terme holobionte pour proposer la théorie que les plastes et les mitochondries dériveraient de cellules procaryotes devenues hôtes permanents d'organismes unicellulaires, établissant des rapports symbiotiques avec eux.
L’approche holistique met l'accent sur les interrelations entre les différents éléments d’un système, et entre le système et son environnement, plutôt que sur les éléments pris isolément.
**Voir :** [[glossaire:entrees:t:theorie_endosymbiotique|théorie endosymbiotique]].