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====== ADN environnemental  ======

===== Définition =====

<WRAP defi_sous_titre>

==== Environnement, Biochimie ====

</WRAP>

<WRAP definition>

<abstract>

Ensemble de fragments d'ADN trouvés dans un environnement particulier (océans, eaux usées, sols, etc.), analysés par les techniques de biologie moléculaire dans le but identifier les espèces les y ayant laissé.

</abstract>

</WRAP>

<WRAP a_voir>

**e. m.**

</WRAP>

<WRAP a_voir>

**Abréviation :** ADNe.

</WRAP>

<WRAP a_voir>

**Voir :** [[glossaire:entrees:a:adn|ADN]], [[glossaire:entrees:e:eau_usee|eau usée]], [[glossaire:entrees:e:espece|espèce]].

</WRAP>

<WRAP t_ic>

===== Informations complémentaires =====

</WRAP>

Les échantillons prélevés dans l’environnement contiennent une multitude de fragments d’ADNe.


Les ADNe (animaux ou végétaux) viennent de cellules contenues dans les sécrétions ou excrétions, ou encore des tissus venant de blessures et d’individus morts, de mucus, peau mortes, poils, et carcasses.


L’ADNe est déjà utilisé dans plusieurs domaines, en particulier : l’épidémiologie, la biodiversité, la paléobiologie.


<WRAP a_voir>

**Voir :** [[glossaire:entrees:b:biodiversite|biodiversité]], [[glossaire:entrees:e:epidemiologie|épidémiologie]], [[glossaire:entrees:e:excretion|excrétion]], [[glossaire:entrees:s:secretion|sécrétion]], [[glossaire:entrees:s:sediment|sédiment]], [[glossaire:entrees:s:sol|sol]].

</WRAP>

<WRAP ic_rp_rdd_titre2sous>

=== La méthode ===

</WRAP>

La méthode vise non pas à caractériser génétiquement un individu, mais à identifier les espèces dont elles proviennent. Cette méthode s’appuie sur des techniques de biologie moléculaire (PCR, séquençage, etc.) et des moyens informatiques puissants.


L’identification des espèces à partir de leur ADN nécessite qu’une partie de leur génome (la plus complète possible) soit déjà décryptée et enregistrée dans une base de données de références. Ces séquences génétiques sont qualifiées de séquences codes-barres moléculaires.


<WRAP a_voir>

**Voir :** [[glossaire:entrees:g:genome|génome]], [[glossaire:entrees:p:pcr|PCR]], [[glossaire:entrees:s:sequencage_de_l’adn|séquençage de l’ADN]].

</WRAP>

<WRAP ic_rp_rdd_titre_sous>

==== Épidémiologie et analyse des eaux usées ====

</WRAP>

Cette méthode des ADNe appliquée aux eaux usées donne une vue globale de l’évolution d’une épidémie, dans un quartier, dans une région, sans que l’on soit obligé de passer par une compilation de données individuelles. La méthode donne donc une vue rapide, quantitative (estimation du nombre d’individus touchés) et qualitative (nature du variant, quartiers touchés) de l’épidémie. 


Toutefois, l’absence d’ADNe d’une espèce ne signifie pas forcément l’absence de celle-ci dans le milieu échantillonné.


<WRAP a_voir>

**Voir :** [[glossaire:entrees:e:epidemie|épidémie]],

</WRAP>

<WRAP ic_rp_rdd_titre_sous>

==== Biodiversité d’un milieu ====

</WRAP>

L'Unesco et sa Commission océanographique intergouvernementale veulent s'appuyer sur cette approche de l’ADNe pour étudier les effets des changements du milieu marin sur les espèces marines et d’évaluer la vulnérabilité de la biodiversité. Les applications permettent :


  * une analyse mondiale des migrations des espèces ;
  * un suivi des espèces figurant sur la liste rouge des espèces de l’Union internationale pour la conservation de la nature (UICN) ;
  * de mieux comprendre les écosystèmes marins, et donc d’améliorer la gestion des aires marines protégées inscrites au patrimoine mondial de l'Unesco.

Toutefois, de grandes précautions méthodologiques doivent être prises, puisque, par exemple, en zone côtière il est possible de détecter de l’ADN de poissons ne vivant pas dans ces eaux, mais venant de restaurants côtiers !


<WRAP a_voir>

**Voir :** [[glossaire:entrees:a:aire_marine_protegee|aire marine protégée]], [[glossaire:entrees:b:biodiversite|biodiversité]], [[glossaire:entrees:d:dechet|déchet]], [[glossaire:entrees:e:ecosysteme|écosystème]], [[glossaire:entrees:l:liste_rouge_des_especes_menacees|liste rouge des espèces menacées]], [[glossaire:entrees:u:uicn|UICN]], [[glossaire:entrees:u:unesco|Unesco]].

</WRAP>

<WRAP ic_rp_rdd_titre_sous>

==== La paléobiologie ====

</WRAP>

L’ADN une fois dans l’environnement se dénature et se dégrade souvent rapidement (quelques heures), mais certaines études de sédiments, de glaces, ont permis de trouver des ADN (mal conservés) de plusieurs centaines milliers d’années.